故事旁白從雷克斯·路瑟開(kāi)始，描述超人所作的英雄事跡及形象。雷克斯描述超人作為一個(gè)地球上的神，但堅持說(shuō)“該來(lái)的時(shí)候，甚至是神也必須要死”。
　　露易絲·蓮恩和超人正在浪漫的約會(huì )，但露意絲對他們的關(guān)系安排并不滿(mǎn)意。超人堅持認為，兩人的關(guān)系只能隱密地在孤獨堡壘中度過(guò)。他還沒(méi)有向他透露自己真實(shí)身份是克拉克·肯特，盡管露意絲已經(jīng)開(kāi)始懷疑。
　　另一方面雷克斯公司挖掘到一艘太空船，當工人正在執行挖掘的工作時(shí)不小心將基因改造的兇殘怪物末日殺手釋放。末日殺手將工人們全數殺害后一步步走到了都市，一路上將鹿、狗、狗的主人全都殺死。橫沖直撞的末日殺手到達大都市后隨即被超人發(fā)現，兩人并展開(kāi)大戰。最后超人全力抓著(zhù)它從高空直落撞擊地面，露易絲與同事吉米·奧爾森告訴受重傷的超人已成功打倒敵人，但超人也因受傷過(guò)重而斷了氣。
　　世界集體哀悼他們倒下的英雄，并在公園建立了超人的紀念碑。后來(lái)雷克斯將他的女助理一槍殺死以確保再也沒(méi)人知道雷克斯公司和末日殺手的出現有關(guān)。后來(lái)吉米對超人的死相當難過(guò)，意外地到了其他大間的報社上班。超人死后，犯罪率增加，玩具人操控著(zhù)巨大機械蜘蛛并挾持了一輛戴滿(mǎn)小孩的校車(chē)在屋頂上，露易絲決定將人質(zhì)救出，便獨自前往，但在遇到危機時(shí)，超人意外地及時(shí)出現制伏了玩具人。露易絲開(kāi)心地和復活的超人一吻，后來(lái)超人的養母瑪莎感到質(zhì)疑為什么他沒(méi)有打電話(huà)回家，露易絲也認為超人有點(diǎn)奇怪。
　　后來(lái)透露其實(shí)復活的超人是雷克斯制造的克隆人，雷克斯在超人與末日殺手一戰時(shí)采集了前者的血液，因此復制超人只聽(tīng)命于雷克斯。后來(lái)雷克斯將復制超人引到了一間有紅色太陽(yáng)光的房間，并戴上氪石的手套不斷打擊他藉以發(fā)泄。打完后雷克斯便前去看他私自挖出的超人本尊尸體。但實(shí)際上超人還活著(zhù)，并偷偷地被超人的機器人助手移到孤獨堡壘中恢復。
　　復制超人在看到逃獄后的玩具人殺死了一名4歲的女孩的報導時(shí)，性格突然變得灰暗，即刻前去把玩具人殺掉，此作法使得周遭的人感到奇怪，警察也開(kāi)始追捕他，露易絲認為他不是真的超人。后來(lái)露意絲和吉米發(fā)現了雷克斯想要復制超人大軍的計劃，在雷克斯正打算將兩人解決時(shí)，突然復制超人出面幫助了兩人且還將所有的復制超人試管全數破壞，因為復制超人自行將自己體內含鉛的氪石拿出使得雷克斯無(wú)法控制他。
　　另一方面真正的超人在機器人助手的幫助下漸漸恢復力量，但后來(lái)聽(tīng)到有關(guān)軍隊和復制超人開(kāi)戰的消息便即時(shí)前往，但因力量只恢復了六成，機器人給他穿上了黑色的太陽(yáng)超人裝并將氪石槍交給超人。后來(lái)超人便和復制超人展開(kāi)對戰，超人的氪石槍被打飛至遠處，超人持續處于下風(fēng)，露易絲將氪石槍撿起并打算射復制超人時(shí)被對方破壞了槍?zhuān)词薜袅顺鰜?lái)。復制超人在石油地打倒超人時(shí)將一旁的紀念碑舉起打算了結對方，超人用熱力射線(xiàn)將黏于復制超人胸口的氪石罐打破冒出了大量的氪氣體，復制超人因此敗北。臨死前，他告訴超人要保護人民。露易絲確定了他是真正的超人并親吻了他，同時(shí)也贏(yíng)得大家的信賴(lài)。
　　超人在露易絲的公寓，發(fā)現她的文章“復活”拼錯，并戴上眼鏡證明自己就是克拉克，露易絲便高興地擁抱他。在雷克斯公司，雷克斯先前被復制超人打成重傷，但仍活著(zhù)敘述歷史已經(jīng)證明，神可以死，但他們還可以回到從死里復活。他對自己微笑、沉思，可能又再想要如何摧毀超人。